Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdh12Q5RJH3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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