Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf3Q5HZG4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms