Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms