Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms