Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms