Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp235Q499D5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp235Q499D5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms