Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms