Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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