Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Lrrc43Q3V0L5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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