Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms