Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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