Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms