Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms