Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms