Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms