Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms