Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tatdn3Q3U1C6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms