Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc174Q3U155 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms