Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy4Q3TYX8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms