Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms