Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms