Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f1Q3THK3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2f1Q3THK3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms