Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms