Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms