Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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