Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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