Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col19a1Q0VF58 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms