Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms