Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms