Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms