Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms