Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cntn3Q07409 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms