Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms