Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms