Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sox9Q04887 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sox9Q04887 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sox9Q04887 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sox9Q04887 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sox9Q04887 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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