Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms