Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms