Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms