Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fgfr4Q03142 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgfr4Q03142 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms