Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1sQ02789 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms