Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VcpQ01853 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms