Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col1a2Q01149 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms