Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms