Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms