Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms