Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms