Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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