Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms