Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms