Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms